Redes espaciales

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Redes espaciales Carlos Reynoso UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES http://carlosreynoso.com.ar

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Buenos Aires, Editorial Sb, 2010 Autómatas celulares Modelos basados en agentes Dimensión fractal Gramáticas complejas Sintaxis espacial Modelos de sociofísica Redes sociales...

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Modelos complejos Elementos en común Microscópicos y emergentes Complejidad del conjunto, simplicidad de los elementos De abajo hacia arriba Cómo se vincula lo micro y lo macro Distribuciones no aleatorias Pareto, Zipf (palabras y ciudades), Gutenberg-Richter Efecto de mundos pequeños Seis grados de separación – Kevin Bacon Oracle Fractalidad e independencia de escala No linealidad Vinculación de estructura y proceso Sensitividad extrema a las condiciones iniciales Efecto “ala de mariposa” Caos determinista Se puede predecir el patrón del conjunto (atractores extraños) pero no el comportamiento individual

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Referencias Reynoso, Carlos – Redes sociales y complejidad – Modelos interdisciplinarios en la gestión sostenible de la sociedad y la cultura. Buenos Aires, Sb, 2011

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Referencias: GRASS

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Top SNA Software (Links) CoSBiLab Cytoscape Gephi Network Workbench ORA Netscenes Pajek SocNetV Tulip

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Agna

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CoSBiLab

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CoSBiLab Integrado a herramientas de modelado más generales Prestaciones de visualización interesantes Representación gráfica de nodos y aristas, H-sinusoide, V-sinusoide, espiral, layout de globo-árbol (sólo para gráficos acíclicos dirigidos) Formatos de archivo raros y más bien pocos GraphViz, MRMC, Ucinet (con restricciones), Blenx SPEC, SBML, Biopax 2 Algoritmos únicos Especificación de variantes de cálculos (Dijkstra shortest path, Bellman Ford shortest path),Dominator, niche, coeficientes de vértice (status, contrastatus, net status, K index), etc

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Cytoscape

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Cytoscape Múltiples formatos de importación y exportación Múltiples layouts de alta calidad gráfica Formatos usuales además de jerárquicos, Sugiyama, simulación de templado, globos, etc Visualización de estadísticas, fit con ley de potencia, ploteo y visualización de parámetros No puede generar redes no vacías

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Cytoscape – Análisis estadístico

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Gephi

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Gephi Redes hasta 50.000 nodos y 1.000.000 de vínculos Estadísticas usuales, detección de comunidades, grafos jerárquicos Variedad moderada pero perfección gráfica de layouts Yifan Hu con enfriamiento adaptativo, Fruchterman-Rheingold, Force Atlas Importación de grafos temporales en GEXF Edición gráfica en ventana de grafos Infinidad de complementos instalables Agregación dinámica de plugins

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JGraphEd

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Krackplot

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Network Workbench Primer ambiente dedicado a redes complejas

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Network Workbench Numerosos formatos soportados GraphML, XGMML, Pajek *.net y *mat, NWB, CSV, Scopus, NSF grant dabatase, Endnote, Bibtex, *.isi Exportación a Postscript, Gnuplot (PDF) Numerosas operaciones de preprocesamiento, cientometría y análisis Modelado de grafos Aleatorios, WS, scale free, CAN, chord, hipergrid, PRU, TARL, Discrete Network Analysis, etc Innumerables visualizaciones GUESS, Gnuplot, JUNG, Tree map, Balloon, Force directed, Kamada-Kawai, Fruchterman-Rheingold, Small World, LaNet, etc No es fácil modular visualizaciones En comparación con Gephi o Cytoscape No tiene prestaciones de edición manual

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Network Workbench Mundo pequeño WS, 200, Small World

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ORA

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ORA La más amplia colección de visualizaciones, análisis y operaciones Numerosos formatos de lectura y escritura Edición en ventana de visualización Gestión de redes de conocimiento, texto, redes sociales, redes espaciales, propagación de creencias, redes de influencia, distribución estadística, evaluación geo-espacial, localización de subgrupos, lazos simmelianos, detección de patrones espaciales, cuenta de tríadas, semejanza cognitiva

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Análisis espacial en ORA

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Pajek

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SocNetV

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Visualizador con algunas prestaciones analíticas Tamaño máximo no documentado Creación de mundos pequeños, grafos de Erdös-Rényi, web crawler Visualización significativa: Radial o en capas por centralidad, Fruchterman-Rheingold, spring embedder, aleatoria, círculo aleatorio Estadísticas de simetría, número de cliques, coeficiente de clustering, centro de tríadas Importación de formatos Pajek, DL, lista de nodos, matriz de adyacencia, GraphML Exportación de gráficos y datos a Pajek y matriz de adyacencia, GraphML Edición de grafos levemente impráctica SocNetV

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Visone

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Windisc TSP con 10 nodos

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¿Preguntas? Carlos Reynoso UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES http://carlosreynoso.com.ar

Summary: Metodos estadisticos sobre redes espaciales

Tags: redes estadisticas complejidad

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